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      轉錄組測序

      作者:小編 更新時間:2022-05-06 點擊數:

        廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合。轉錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質組的必然紐帶,轉錄水平的調控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調控方式。轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息,從而發現新的轉錄本和可變剪接體。利用illumina大規模測定mRNA序列獲得轉錄本信息,該技術具有通量高、覆蓋廣、精度高的特點。


      無參考基因組序列的轉錄組生物信息學分析主要包括:

          1. 測序數據產量統計、數據成分和質量評估;

          2. 采用RNA-seq軟件重建轉錄子;

          3. Contig和Scaffold長度分析;

          4. Unigene長度分部,功能注釋,功能分類(GO,COG,KEGG),代謝通路分析;

          5. 分析不同樣本間的存在差異表達的基因統計;

          6. 差異基因的代謝通路富集分析(GO,COG,KEGG)。

       

      有參考基因組序列的轉錄組生物信息學分析主要包括:

              1. 測序數據產量統計、數據成分和質量評估;

              2. 分析不同樣本間的存在差異表達的基因;

              3. 差異基因的代謝通路富集分析(GO,COG,KEGG);

              4.可以在全基因組范圍內檢測存在的可變剪切現象;

              5. LncRNA分析;

              6. SNP分析等;

              7. SSR分析;

              8. 融合基因分析(可選)。

       


      1. 數字化信號:直接測定每個轉錄本片段序列,分辨率可達單個核苷酸(SNP),同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題;

      2. 高靈敏度:能夠檢測到細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;

      3. 任意物種的全基因組分析:無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進行轉錄組分析;

      4. 更廣的檢測范圍:高于6 個數量級的動態檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和共有轉錄本。

      5. 我們采用鏈特異性文庫,為研究者提供更準確的基因表達信息。



      樣品類型

        1. 總RNA;樣品濃度:≥250 ng/ul;樣品總量:>6ug(真核生物);>10ug(原核生物)樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值。RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。

        2. 組織:植物組織樣品取樣后用錫箔紙包裹并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中;動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提?。ㄆ胀悠?.6g以上,RNA含量少的花、果實等組織需要加量送);

       

      樣本運輸

        1. 總RNA樣品請溶于RNase-free H2O或乙醇中,置于1.5 ml RNase-free離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口,干冰運輸;

        2. 植物組織、動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。


      飛凡檢測質檢報告流程

      1、 提供產品資料

      2、 工程師根據您品資料的產品推薦合適檢測項目,并給出報價

      3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室

      4、 支付檢測費用,安排檢測

      5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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      飛凡檢測致力于打造國內專業的第三方檢測服務公司,不斷優化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學,蘇州大學,SGS,TUV,以及國內眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內制造業服務,為中國的制造業開拓海外市場保駕護航,為我們日常生活的健康安全樹立標桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質,確保出具的每份報告都具有權威的法律效力。



      為什么選擇我們

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