鑒定microRNA（miRNA）調控的靶基因是闡釋miRNA復雜調控機制的關鍵。在生物體內，miRNA除了抑制mRNA的翻譯外，也會誘導mRNA被剪切降解，從而調控基因表達，發揮生物學功能。相比于動物，在植物中miRNA誘導基因剪切降解的方式會更為普遍。

        降解組測序（Degradome Sequencing）主要針對miRNA介導的剪切降解片段進行深度測序，從實驗中篩選miRNA作用的靶基因，并結合生物信息學分析優勢，確定降解片段與miRNA精確的配對信息。

        該技術既擺脫了僅利用生物信息學預測靶基因帶來的高假陽性，又避免了常規靶基因鑒定手段（如5’ RACE）低通量耗時耗力的不足，顯著促進了miRNA的功能研究。且能從細胞或組織中準確高效地篩選出miRNA的靶基因，為研究miRNA與其對應的靶基因的相互關系提供準確、高效的篩選手段。

    1. 質檢文件：樣本質檢報告和質控報告；

    2. 測序數據質量評估；

    3. 鑒定mRNA降解片段；

    4. 降解組密度文件（Degradome Density File）的生成；

    5. miRNA靶基因生物信息學預測；

    6. miRNA靶基因的實驗性確認；

    7. t-plot構建；

    8. 多樣本的miRNA靶基因的比較分析（兩個及以上樣本有此分析內容）。

    1. 高通量：一次測序可鑒定得到1千萬條以上的miRNA作用的靶基因序列信息，可充分覆蓋該物種中的所有mRNA降解片段；

    2. 高準確性：可實現從幾個到幾十萬個拷貝的精確計數，提供Q30以上數據，確保數據分析的準確性；

    3. 高分辨率：可精確檢測到單堿基差異；

    4. 重復性好：深度測序保證了檢測的隨機性，背景噪音低，不需要技術的重復；

    5. 全方位服務：提供miRNA鑒定、靶基因篩選等研究的一站式解決方案。

（一）樣品類型

　　1. 總RNA：樣品濃度≥200 ng/μl，樣品總量≥30 μg；樣品純度： OD260/280為1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260 nm處有正常峰值。RNA完整性： 電泳檢測28S/18S≥1.5。

　　2. 組織：植物組織樣品取樣后用錫箔紙包裹并標注，立即液氮速凍，保存于液氮或超低溫冰箱中；動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注，立即液氮速凍，保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提?。ㄆ胀悠?.6g以上，RNA含量少的花、果實等組織需要加量送）；

（二）樣本運輸

　　1. 總RNA樣品請溶于RNase-free H2O或乙醇中，置于1.5 ml RNase-free離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口，干冰運輸；

　　2. 植物組織、動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注，使用足量的干冰運輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運輸過程中樣品降解的可能性。