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      降解組測序

      作者:小編 更新時間:2022-05-07 點擊數:

              鑒定microRNA(miRNA)調控的靶基因是闡釋miRNA復雜調控機制的關鍵。在生物體內,miRNA除了抑制mRNA的翻譯外,也會誘導mRNA被剪切降解,從而調控基因表達,發揮生物學功能。相比于動物,在植物中miRNA誘導基因剪切降解的方式會更為普遍。

              降解組測序(Degradome Sequencing)主要針對miRNA介導的剪切降解片段進行深度測序,從實驗中篩選miRNA作用的靶基因,并結合生物信息學分析優勢,確定降解片段與miRNA精確的配對信息。

              該技術既擺脫了僅利用生物信息學預測靶基因帶來的高假陽性,又避免了常規靶基因鑒定手段(如5’ RACE)低通量耗時耗力的不足,顯著促進了miRNA的功能研究。且能從細胞或組織中準確高效地篩選出miRNA的靶基因,為研究miRNA與其對應的靶基因的相互關系提供準確、高效的篩選手段。


          1. 質檢文件:樣本質檢報告和質控報告;

          2. 測序數據質量評估;

          3. 鑒定mRNA降解片段;

          4. 降解組密度文件(Degradome Density File)的生成;

          5. miRNA靶基因生物信息學預測;

          6. miRNA靶基因的實驗性確認;

          7. t-plot構建;

          8. 多樣本的miRNA靶基因的比較分析(兩個及以上樣本有此分析內容)。



          1. 高通量:一次測序可鑒定得到1千萬條以上的miRNA作用的靶基因序列信息,可充分覆蓋該物種中的所有mRNA降解片段;

          2. 高準確性:可實現從幾個到幾十萬個拷貝的精確計數,提供Q30以上數據,確保數據分析的準確性;

          3. 高分辨率:可精確檢測到單堿基差異;

          4. 重復性好:深度測序保證了檢測的隨機性,背景噪音低,不需要技術的重復;

          5. 全方位服務:提供miRNA鑒定、靶基因篩選等研究的一站式解決方案。



      (一)樣品類型

        1. 總RNA:樣品濃度≥200 ng/μl,樣品總量≥30 μg;樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260 nm處有正常峰值。RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。

        2. 組織:植物組織樣品取樣后用錫箔紙包裹并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中;動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提?。ㄆ胀悠?.6g以上,RNA含量少的花、果實等組織需要加量送);

       

      (二)樣本運輸

        1. 總RNA樣品請溶于RNase-free H2O或乙醇中,置于1.5 ml RNase-free離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口,干冰運輸;

        2. 植物組織、動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。


      (三)飛凡檢測質檢報告流程:

          1、 提供產品資料

          2、 工程師根據您品資料的產品推薦合適檢測項目,并給出報價

          3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室

          4、 支付檢測費用,安排檢測

          5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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      飛凡檢測致力于打造國內專業的第三方檢測服務公司,不斷優化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學,蘇州大學,SGS,TUV,以及國內眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內制造業服務,為中國的制造業開拓海外市場保駕護航,為我們日常生活的健康安全樹立標桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質,確保出具的每份報告都具有權威的法律效力。



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      市場需求和成熟的模式給了我們成功的保證


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