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      MeDIP-Seq全基因組甲基化檢測技術

      作者:小編 更新時間:2022-05-07 點擊數:

        Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing (MeDIP-Seq)技術基于抗體富集原理進行測序的全基因組甲基化檢測技術,采用甲基化DNA免疫共沉淀技術,通過5′-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段,然后通過高通量測序可以在全基因組水平上進行高精度的CpG密集的高甲基化區域研究??梢钥焖儆行У貙ふ一蚪M上的甲基化區域,從而比較不同細胞、組織或疾病樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異。



      1、數據產出統計:對測序結果進行圖像識別、去污染、去接頭,統計結果包括read長度、read數據、數據產量;

      2、MeDIP 測序序列與參考基因組序列的比對;

      3、MeDIP測序數據的全基因組分布趨勢;

      4、統計MeDIP測序數據富集區域 ( Peak ) 的信息;

      5、基于peak 的全基因組甲基化差異分析。





      1、需提供至少30ng的抗體富集后的DNA片段(片段長度200-500bp),為保證實驗質量及延續性,請一次提供至少2次樣本制備的量;

      2、樣品濃度和純度:基因組DNA樣品濃度>2ng/μl; OD260/280介于1.8-2.0,無肉眼可見污染;

      3、樣品保存:請選擇乙醇、純水進行保存,并在樣品信息單中注明;

      4、樣品運輸:請將樣品置于1.5ml管中,并用封口膜封好。


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