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      簡化甲基化測序

      作者:小編 更新時間:2022-05-07 點擊數:

        DNA甲基化是表觀遺傳學的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要的作用。針對全基因組甲基化測序成本相對昂貴,即產生了簡化甲基化測序,該方法通過酶切富集啟動子及CpG島區域,硫化處理及片段富集,構建文庫后進行測序,同時實現DNA甲基化狀態檢測的高分辨率和測序數據的高利用率。


              利用限制性內切酶對基因組進行酶切,可以極大幅度的提高CpG區域的測序深度,與全基因組甲基化測序相比減少大量的測序量,在CpG島、啟動子區域和增強子元件區域可以達到高精度分辨率。同時,利用RRBS可以實現多個樣本的比對基因組分析。



      1、數據產出統計及基本的數據質控處理

      2、測序數據與目的物種基因組進行比對

      3、胞嘧啶C的測序深度統計

      4、Promoter和CpG島上覆蓋度及甲基化分析

      5、鑒定胞嘧啶C堿基的甲基化狀態及在基因組上的分布




      1、DNA樣品總量:簡化甲基化測序需要提供2μg的基因組DNA;為保證實驗質量及延續性,請一次性提供至少2次樣本制備量;

      2、樣品濃度和純度:基因組DNA樣品濃度>50ng/μl; OD260/280介于1.8-2.0,無肉眼可見污染;

      3、樣品保存:請選擇乙醇、純水進行保存,并在樣品信息單中注明;

      4、樣品運輸:請將樣品置于1.5ml管中,并用封口膜封好。


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