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環境微生物功能基因的定量檢測分析

作者:admin 更新時間:2022-08-01 點擊數:

  在環境中,微生物起到了重要的作用,而這些作用往往是由微生物的相關功能基因來決定的。比如,氮循環相關功能微生物在土壤發揮其生態功能中起著重要的作用,固氮細菌、反硝化細菌和硝化細菌在石油污染土壤生物修復過程中的演變情況,研究者利用實時定量PCR技術對其相關功能基因nifH、narG和amoA進行檢測,再利用標準曲線計算獲得基因的絕對拷貝數。


        此類研究可以表明結果表明氮循環功能基因的動態監測可以從基因和物種水平上反映土壤修復的效果,為土壤修復的監控和效果評估提供參考。



1、實時監測:通過擴增曲線能夠實時監測PCR產物的積累。

2、特異性強:實驗完成后,溶解曲線的分析可以驗證擴增產物的特異性,降低假陽性。

3、精確定量:利用擴增進入指數增長期的CT值來定量測定起始模板量,從而實現了極為精確的核酸定量檢測??梢允址奖愕闹滥康幕虻暮?。



1. 技術重復質量評估分析;

2. 絕對量計算

 公式(copies/μl)=[質粒濃度(ng/ul)×10-9×6.02×1023] / [ 克隆產物堿基數×660(g/mol)]

 載體(pMD 18-T)堿基數 = 2692 bp

3. 對于有生物學重復的檢測,計算SD和p-value。

 


(一)樣品類型

  1. 總DNA;樣品濃度:≥10 ng/ul;樣品總量:>1ug;樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值。RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。

  2. 組織:樣品取樣后立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提??;

 

(二)樣本運輸

  1. 樣本取樣后置于凍存管中并標注,使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。


飛凡檢測質檢報告流程

1、 提供產品資料

2、 工程師根據您品資料的產品推薦合適檢測項目,并給出報價

3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室

4、 支付檢測費用,安排檢測

5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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